World Families Forums - Analysis of G2a haplotypes from aDNA studies.

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Author Topic: Analysis of G2a haplotypes from aDNA studies.  (Read 2113 times)
JeanL
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« on: May 16, 2012, 10:17:41 AM »

These are the five*(Ave06 did not amplify for M287 or P15 SNPs, but it is assumed to be G2a due to STR match with a 99.6% probability) sample of G2a from the Avellanar Cave, Catalonia 5000 BC:

The STR markers are in the following order:

DYS456--DYS389I--DYS390--DYS389II--DYS458--DYS19--DYS385--DYS393--DYS391--DYS439--DYS635--DYS392--GATAH4--DYS437--DYS438--DYS448

Avellanar Cave, Catalonia 5000 BC

Ave01: 15--12--23--29--18--15--14/14--13--10--11--21--XX--12--16--10--XX
Ave02: 15--12--23--XX--18--15--14/14--13--10--11--21--11--12--16--10--22
Ave03: 15--12--23--29--18--15--14/14--13--10--11--21--11--12--16--10--22
Ave05: 15--12--23--29--18--15--14/14--13--10--11--XX--XX--12--16--XX--22
Ave06: 15--12--XX--XX--18--15--XX/XX--13--10--11--XX--XX--12--16--XX--XX

Modal Value: 15--12--23--29--18--15--14/14--13--10--11--21--11--12--16--10--22

Treilles Cave, SW France 3000 BC

#137: 14--12--23--XX--18--15--XX/XX--14--10--11--XX--XX--11--16--XX--20
#139: XX--12--XX--XX--18--15--XX/XX--XX--10--11--XX--XX--11--XX--10--XX
#195: 14--12--23--30--18--15--13/15--14--10--11--21--XX--11--16--XX--XX
#209: 14--12--23--XX--18--15--13/15--14--10--XX--XX--XX--11--XX--XX--XX
#570: 14--12--23--XX--18--XX--13/15--14--10--11--21--11--11--16--XX--XX
#575: 14--12--23--30--18--15--13/15--14--10--11--21--XX--11--16--10--20
#579: 14--12--23--XX--18--XX--13/15--14--10--11--21--XX--11--16--10--XX
#583: 14--XX--XX--XX--18--XX--13/15--14--10--11--XX--XX--11--16--XX--XX
#584: 15--12--23--30--18--15--13/15--14--10--12--21--XX--11--16--XX--XX
#587: 14--12--23--XX--XX--XX--XX/15--14--XX--XX--21--XX--XX--XX--XX--XX
#588: 14--12--23--XX--18--XX--13/15--14--10--11--XX--XX--11--16--XX--XX
#592: 14--12--23--XX--18--XX--13/15--14--10--11--XX--XX--11--16--XX--XX
#593: 14--XX--XX--XX--18--XX--XX/XX--XX--XX--XX--XX--XX--XX--XX--XX--XX
#600: 14--12--XX--30--18--XX--13/15--14--10--11--21--XX--11--16--10--XX
#604: 14--XX--XX--XX--18--15--XX/XX--14--10--XX--21--XX--11--XX--XX--XX
#612: 14--12--XX--XX--18--XX--13/15--14--10--11--21--XX--11--XX--XX--XX
#615: 14--12--23--30--18--15--13/15--14--10--11--21--11--11--16--10--20
#616: 14--12--23--30--18--15--13/15--14--10--11--21--11--11--16--10--20
#636: 14--12--23--30--18--15--13/15--14--10--11--21--11--11--16--9--XX

Modal Value: 14--12--23--30--18--15--15/13--14--10--11--21--11--11--16--10--20

Mutations:

DYS456: 15=>14

DYS389II: 29=>30

DYS385: 14/14=>13/15

DYS393: 13=>14

GATAH4: 12=>11

DYS448: 22=>20
« Last Edit: July 03, 2013, 10:13:09 PM by JeanL » Logged
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